В Москве изучают ДНК из воды и почвы, чтобы найти виды в заповедных парках
Урожаева: в «Лосином острове» выявили больше 1,6 тысячи видов эукариот
Учёные определяют, какие организмы обитают в московских парках и на особо охраняемых территориях, по следам ДНК в воде, почве и на коре деревьев. Такой способ выявляет больше видов, чем наблюдение в микроскоп.
Проект ведут специалисты Института проблем экологии и эволюции имени А. Н. Северцова РАН вместе с департаментом природопользования Москвы. О нём рассказали на портале мэра и правительства столицы.
Работа стартовала в 2025 году. В первый год пробы воды и почвы взяли на 12 природоохранных территориях, нашли гены устойчивости бактерий к антибиотикам и начали собирать геномную базу.
Глава департамента природопользования и охраны окружающей среды Москвы Юлия Урожаева привела данные по московской части национального парка «Лосиный остров». Там выявили более 1,6 тысячи видов микроскопических эукариот, 276 видов микроводорослей в воде и 157 на коре деревьев.
В 2026 году основное внимание уделили водоёмам. Воду брали в 15 водоёмах «Лосиного острова» и в 17 точках Кускова, Покровского-Стрешнева и Царицына. Для этих мест записали точные координаты, чтобы со временем превратить их в постоянные станции наблюдений.
Полевая часть закончена: воду отфильтровали, ДНК выделили, сейчас материал готовят к секвенированию. Первые итоги ждут в ближайшие месяцы. Данные объединят на одной карте, а накопленная база послужит для создания и проверки моделей, которые предскажут цветение воды.
Генетический анализ помогает заметить рост цианобактерий и водорослей ещё до видимых признаков цветения. Он же выявляет чужеродные виды: ротана, американских раков и дрейссену. Другая задача — санитарно-экологический контроль: учёные изучают гены устойчивости бактерий к антибиотикам, в том числе к карбапенемам.
Чтобы убедиться в точности, генетические данные сравнивают с классическими наблюдениями зоологов и гидробиологов. Те исследуют планктон, донных беспозвоночных и рыб на тех же станциях, где отбирают воду, и это позволяет перепроверять находки и разбирать расхождения между методами.
В дальнейшем методику собираются применять на других природоохранных территориях и водоёмах, а также для анализа почвы и воздуха в Москве и других регионах.
Между прочим. Секвенированием называют определение последовательности мономеров в белках и нуклеиновых кислотах. Для генов обычно применяют метод Сенгера, разработанный в 1977 году, а перед началом работы нужный участок ДНК, как правило, размножают с помощью ПЦР. Полный геном обычно читают технологиями секвенирования нового поколения.